雅安雨禾藥業有限公司前身為原四川雅安制藥廠（國營），1995年，四川雅安制藥廠以全部經營資產和人員與三九藥業（香港）有限公司合資成立了雅安三九藥業有限公司（后更名為華潤三九（雅安）藥業有限公司）。2003年四川雅安制藥廠實施改制，更名為雅安雨禾藥業有限公司。

雅安雨禾藥業有限公司作為華潤三九（雅安）藥業有限公司的持股公司，占其17%的股份。